Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP2BP0DMP2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms