Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms