Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM200BP0CF97 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM200BP0CF97 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms