Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L8P0C7I0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L8P0C7I0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms