Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AB1P08238 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSP90AB1P08238 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms