Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKMP08237 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKMP08237 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKMP08237 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKMP08237 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKMP08237 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKMP08237 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKMP08237 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKMP08237 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKMP08237 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKMP08237 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKMP08237 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKMP08237 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKMP08237 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKMP08237 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKMP08237 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms