Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTMAP06454 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTMAP06454 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTMAP06454 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTMAP06454 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms