Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCAP05165 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCAP05165 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCAP05165 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCCAP05165 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCAP05165 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCCAP05165 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCCAP05165 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCCAP05165 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCAP05165 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCAP05165 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms