Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYBBP04839 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYBBP04839 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYBBP04839 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYBBP04839 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYBBP04839 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYBBP04839 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYBBP04839 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms