Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC2P02655 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC2P02655 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC2P02655 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC2P02655 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC2P02655 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
APOC2P02655 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOC2P02655 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC2P02655 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC2P02655 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms