Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLIT2O94813 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLIT2O94813 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms