Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEBLO76041 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEBLO76041 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEBLO76041 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEBLO76041 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEBLO76041 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEBLO76041 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEBLO76041 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms