Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALMO75781 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALMO75781 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALMO75781 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PALMO75781 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALMO75781 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALMO75781 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALMO75781 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms