Protein–RNA interactions for Protein: O75586

MED6, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED6O75586 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MED6O75586 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MED6O75586 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MED6O75586 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MED6O75586 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MED6O75586 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MED6O75586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MED6O75586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms