Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX3O75364 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX3O75364 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX3O75364 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX3O75364 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX3O75364 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX3O75364 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms