Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP9AO75110 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms