Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL41O60662 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL41O60662 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms