Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PLXNC1O60486 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLXNC1O60486 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLXNC1O60486 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLXNC1O60486 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PLXNC1O60486 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLXNC1O60486 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLXNC1O60486 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLXNC1O60486 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms