Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRNO43815 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRNO43815 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRNO43815 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRNO43815 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRNO43815 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRNO43815 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRNO43815 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRNO43815 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRNO43815 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRNO43815 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRNO43815 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRNO43815 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRNO43815 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRNO43815 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRNO43815 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms