Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTIFO43310 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTIFO43310 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTIFO43310 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTIFO43310 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTIFO43310 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTIFO43310 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTIFO43310 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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