Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRXO43186 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRXO43186 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRXO43186 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRXO43186 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRXO43186 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms