Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFS4O43181 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFS4O43181 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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