Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASTN1O14525 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASTN1O14525 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms