Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GFRA2O00451 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA2O00451 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms