Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
O00370 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
O00370 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
O00370 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
O00370 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
O00370 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
O00370 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
O00370 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
O00370 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
O00370 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
O00370 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
O00370 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms