Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP23O00161 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP23O00161 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms