Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms