Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H7C1C5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H7C1C5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H7C1C5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1C5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H7C1C5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H7C1C5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H7C1C5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H7C1C5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1C5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1C5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1C5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1C5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms