Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3BRM9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3BRM9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BRM9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BRM9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BRM9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BRM9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3BRM9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3BRM9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BRM9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms