Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NACAE9PAV3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NACAE9PAV3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms