Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00587B1AMM8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms