Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD3A6NKT7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD3A6NKT7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD3A6NKT7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD3A6NKT7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD3A6NKT7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD3A6NKT7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD3A6NKT7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms