Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C5orf51A6NDU8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C5orf51A6NDU8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms