Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MEIS3P1A6NDR6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEIS3P1A6NDR6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms