Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms