Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSDA5PKW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSDA5PKW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms