Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms