Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC66A2RUB6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC66A2RUB6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms