Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms