Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCRBV5S1A1TA0A578 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCRBV5S1A1TA0A578 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms