Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 MORC1-201ENST00000232603 3764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AL356234.1-201ENST00000404534 1779 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SLC4A9-204ENST00000506757 3277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 HDC-201ENST00000267845 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SNRNP35-201ENST00000350887 942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 RN7SKP73-201ENST00000411075 292 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SNRNP35-202ENST00000412157 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SGO1-204ENST00000417364 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SGO1-207ENST00000425061 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AL022315.1-201ENST00000428838 498 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 LINC01621-201ENST00000438797 481 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SGO1-210ENST00000443724 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 Z97205.1-201ENST00000451328 448 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SGO1-211ENST00000452020 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC117402.1-201ENST00000485473 856 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 AC083841.3-202ENST00000519411 349 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC009630.1-201ENST00000523081 559 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.194-201ENST00000612213 283 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 FCRL6-203ENST00000368106 1306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 WSB2-203ENST00000535496 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 ARR3-205ENST00000620997 1309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 THAP5-201ENST00000313516 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPRJQ12913 STAM-AS1-201ENST00000563601 2595 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
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PTPRJQ12913 AC007741.1-201ENST00000623818 3495 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TAAR6-201ENST00000275198 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SPANXA2-201ENST00000370518 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 SPANXA1-201ENST00000370519 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 APOBEC3F-202ENST00000381565 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 C2orf70-202ENST00000409392 764 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC097523.1-201ENST00000429515 637 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PRAMEF32P-201ENST00000431596 1068 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 GPAA1P1-201ENST00000453019 931 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 TRAPPC12-AS1-201ENST00000453806 908 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 AP001625.1-202ENST00000455116 450 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 CGGBP1-203ENST00000462901 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPRJQ12913 RN7SL79P-201ENST00000484117 290 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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