Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQ87 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQ87 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQ87 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQ87 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQ87 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQ87 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQ87 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQ87 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQ87 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQ87 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQ87 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQ87 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQ87 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
U3KQ87 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQ87 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQ87 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQ87 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms