Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A4Q9Y6R1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms