Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TIMM9Q9Y5J7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TIMM9Q9Y5J7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms