Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2L3Q9Y4A8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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