Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN4Q9Y3Q4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms