Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HDGFL3Q9Y3E1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms