Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG6Q9Y2V7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG6Q9Y2V7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COG6Q9Y2V7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms