Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR1DQ9Y2S0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms