Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRAPPC8Q9Y2L5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms